Usando areá de trabalha remota + certificados + VM + Windows Serve

O certificado instalado no servidor quando é acessado a areá remota ele não enxerga o certificado. Se fosse o certificado A1 não aconteceria por que pode ser instalado no servidor.

Instale os driver do cartão ou do tokem, depois instale o gerenciador de certificados normalmente no servidor como você faz numa estação de trabalho, tem que ver no site da leitora e do certificado se tem para o Serve.

A mesma instalação feita no servidor tem que ser feita no teminal virtual.

Acesse o terminal serve e escolha a Opções:

Clique na aba Recursos Locais:

Clique em Mais.

Selecione as opções a seguir:

Faça o teste e veja se esta funcionando o seu certifica no terminal serve

Para testar:

Entre neste site https://cav.receita.fazenda.gov.br/eCAC/publico/login.aspx

Clique no botão Certificado Digital.

Espero ter ajudado, qualquer duvida comente que te responderei.